目前，民办高校作为高等教育办学体制改革实践的重要成果，不仅在数量上达到了相当的规模，而且形成了一定的结构、层次和办学特色，在科学研究、人才培养、社会服务等方面，为社会各项发展作出了贡献，已成为我国高等教育事业不可或缺的重要组成部分。但在充分肯定民办高校制度建设取得显著进步的同时，也必须清醒看到，当前民办高校的发展仍面临着不少突出问题和矛盾，存在着诸多亟待破解的制度瓶颈。主要体现在：一是民办高校产权不明晰，无法形成有效的激励与约束机制，导致举办者追求短期效益，为学校埋下了民事责任和侵权债务等诸多的隐患；二是民办高校缺少科学规划和正确引导，不少民办高校普遍存在低水平重复建设现象，学科专业（或课程）缺乏特色，教育教学质量不高，没有形成比较优势，缺乏市场竞争力，也在很大程度上制约和影响了自身的深入、持久发展；三是民办高校师资力量薄弱，骨干教师流失严重，没有形成有效的内部培训机制；四是民办高校办学经费短缺，影响办学条件的改善、师资队伍建设等，进一步制约了社会资金的再投入。

具体建议：一是从政策层面着力解决公平待遇问题，促进民办、公办高校共同繁荣。要坚持教育公益性的前提下，尽快分类明确民办高校初期投入及增值资产的最终归属，并及早制定出台出资者的合理回报政策，以激励更多社会资金转化为教育资源。在明确民办、公办学校具有同样公益属性和同等法律地位的前提下，借鉴OECD国家的经验，改变对民办高校的狭隘理解，建立健全公共财政对民办高校的直接资助制度。同时，尽快分类制定民办高校的税收、土地、金融及其他配套优惠政策。对由于历史原因尚未落实法人财产权的民办高校，应全额减免举办者资产过户的相关税费。在学校法人资产不能设定抵押的情况下，要鼓励和支持银行系统向民办高校实行信用贷款、收费权质押贷款以及第三方担保贷款等方式，多渠道解决民办高校融资难问题。

二是加快政府职能转变，依法落实民办高校办学自主权。在民办高校行政管理方面，政府主要职责在于制定各类有关民办高校的政策、法规、规章、制度和标准，制定民办高校事业的发展规划，培育和发展教育要素市场，依法对民办高校实施督导和检查。在民办高校运行层面，政府应当遵循“最少介入”原则，把办学竞争的利益和责任“归还学校，回归社区”，并且要从过于微观、具体、细致的管理职能中退出，把学校的微观职能“归还校长，回归学校”，确保学校作为相对独立的法人依法自主办学的权利。在保障民办高校依法自主办学方面，关键是要落实四项自主权：允许民办高校自主招生，并实行适合自身特点的培养模式；允许民办高校自主颁发文凭（或学业证明），其学历（学力）价值由市场检验；允许民办高校自主进行服务定价，收费实行市场调节；允许民办高校自主设置专业与课程，真正面向市场办学。

三是坚持正确引导和依法管理，切实规范民办高校办学行为。规范也是一种扶持，民办高校发展过程中确实存在不少问题，一些民办院校在办学中所发生的无序竞争和失范行为，不仅有损于社会正义与公平，也有害于社会的稳定和谐，不利于民办高校整体事业的健康发展。为此，各级政府部门务必高度重视，采取切实措施，加以调整和规范。

（一）在意识形态和思想观念上对民办、公办两类学校公平对待、一视同仁，彻底消除和摒弃对民办高校的歧视及偏见。

（二）在制度安排和政策制定上破除垄断、开放“市场”。凡是允许公办学校开办的学科专业，也应允许民办高校开办；对于符合办学条件的民办高校，应准许其申办相应层次和类型的教育。

（三）在民办高校设置审批上统一标准、严格准入，对于不具备办学条件的申报者，一律不予审批；而对于办学条件不达标的，限期加以整改，否则应予以“关停并转”。四要对部分民办高校存在的不规范办学行为，依法加强监管、整治和查处。在民办高校的办学监管上，相关部门要按各自职责分工，建立促进民办高校健康发展的工作协调机制，积极构建政府依法管理、民办高校依法办学、行业自律和社会监督相结合的民办高校工作格局。

四是培育规范中介组织，拓宽共管共促民办高校发展的空间。随着政府对民办高校管理职能的转变，需要培育、规范民办高校中介组织。首先，区分政府与民办高校中介组织的定位，将专业性咨询、评估、监管等职能分离出来，交由专业化的中介组织承担。其次，健全民办高校中介组织的法律法规，完善民办高校中介组织的资格审查、准入、资助、监管和行业自律制度，引入竞争机制，构建有利于中介组织发展的良好外部环境和制度环境。再次，强化政府对民办高校中介组织的培育意识和支持举措，充分发挥各类民办高校研究机构和各级民办高校协会、学会在民办高校公共治理中的作用。最后，逐步将民办高校政策咨询、考试鉴定、质量评估、人员培训、信息交流等工作交由中介组织来完成，支持中介组织履行专业服务、管理指导、沟通协调、资源整合、自律互律等职能，拓宽中介组织共管共促民办高校发展的空间。